间接型颈动脉海绵窦瘘的临床表现取决于引流静脉的部位、大小，与供血动脉关系不大。临床上可以毫无症状，也可以出现致命的脑内出血。最多见的临床症状有：
1.突眼 约占50%。
2.颅内杂音 50%～70%的病人会出现，剧烈运动时杂音增强，压迫患侧颈总动脉杂音减轻或消失。
3.颅内出血 可表现为蛛网膜下腔出血、硬膜下血肿或脑内血肿。
4.视力减退 约占27%，严重时病人在数小时内完全失明;较轻度的视力减退经治疗可能恢复，但完全失明的病人，即使瘘口闭塞，视力也无法挽救。
5.头痛 也较常见，可为海绵窦内压力增高导致颅内压增高，或扩张的动静脉刺激脑膜、压迫三叉神经半月节，甚至是少量硬脑膜下腔或蛛网膜下腔出血的刺激等引起。
上述症状与直接型瘘相比大多较轻，病程也较缓慢。
间接型颈动脉海绵窦瘘以中老年及妊娠妇女为主，常自发起病，病程一般较长，发展比较缓慢，可有头痛、突眼、颅内杂音、视力减退等症状，诊断一般不难。CT和MRI表现除突眼、脑水肿、脑出血等继发性病变外，还可显示增粗的眼静脉和皮质引流静脉。在MRI上发现紧邻硬脑膜的“流空”影，具有重要诊断意义。但CT和MRI检查阴性并不能排除本病。确诊还需依靠全脑血管造影。