机体免疫良好的CMV感染者大多数呈无症状的隐性感染，因而成为骨髓和器官移植者CMV感染的传染源。所以，在进行移植前对供体进行CMV血清学检查是十分重要的。移植后发生巨细胞病毒性肺炎存在如下临床表现：
1.急进型
在移植后1～2月即出现发热、咳嗽、不适、呼吸困难、活动力下降、缺氧和呼吸衰竭;肺部听诊多无体征，合并细菌或真菌感染者可闻及啰音;病情进展快，可迅速恶化和死亡。常见于原发感染，体内无特异性抗体，因而发病急、重，易导致全身病毒血症和继发细菌、真菌感染。
2.缓进型
移植后3～4月发生，症状与急进型相似，但进展缓慢，症状较轻，死亡率低;肺部X线表现为弥漫性间质性肺炎、纤维化;病理表现为肺泡间质水肿，不同程度的纤维化，淋巴细胞浸润和上皮细胞增生。常见于CMV再感染或潜伏的病毒激活所致。
AIDS患者CMV肺炎无特异性，常合并全身CMV感染，如视网膜炎、结肠炎、胆管炎和食管炎。