西医病因：
1.细菌和毒素的感染以沙门菌属和嗜盐菌(副溶血弧菌)感染最常见，毒素以金黄色葡萄球菌素常见;病毒亦可见到。常有集体发病或家庭多发的情况。如吃了被污染家禽、家畜的肉、鱼;或吃了嗜盐菌生长的蟹、螺等海产品及吃了被金黄色葡萄球菌污染了的剩菜、剩饭等而诱发本病。
2.物理化学因素进食生冷食物或某些药物如水杨酸盐类、磺胺、某些抗生素等;或误服强酸、强碱及农药等均可引起本病。
中医病因：
1.感受时邪夏秋之际暑湿蒸腾，若调摄失宜，感受暑湿秽浊之气，或因贪凉露宿，寒湿入侵，寒邪秽气，郁遏中焦，使脾胃受损，升降失司，清浊相干，发为本病。
2.饮食不节、饮食不洁误进腐馊变质之物或贪凉饮冷，恣食生冷瓜果、暴饮暴食，直接损伤脾胃，导致清气不升，浊气不降，吐泻交作，发为本病。
3.脾胃虚弱素体脾胃虚弱，熟腐运化水谷不力，稍有饮食不慎，即水谷停滞、清浊不分，发为本病。
发病机理：
沙门菌具有侵袭性，引起粘膜炎症反应，伴粘膜下层中性粒细胞浸润，有时可深至固有层。炎症细胞产生和释放前列腺素，使腺苷酸环化酶活性增高。沙门菌分泌肠毒素，直接刺激腺苷酸环化酶系统，使肠液分泌能力大大增加。超过肠道重吸收能力，引起起腹泻。
脾胃位于中焦，脾主运化水谷，转输津精，升举清气，胃主受纳水谷，其气主降，夏秋之际，病者贪凉或误食腐馊之物，致使脾胃受伤，升降失司，清浊相干，乱于胃肠而致上吐下泻发为本病。
病理：
胃肠粘膜充血、水肿，表面有片状灰黄色渗出物和粘液覆盖，病变可呈局限性或弥漫性。粘膜皱襞上有糜烂、出血点。如表层上皮细胞坏死脱落，固有膜血管受到损害则引起出血和血浆外渗，往往有中性白细胞、淋巴细胞、浆细胞和少量嗜酸性细胞浸润，严重者粘膜下层亦有充血、水肿。沙门菌性胃肠炎时小肠是主要的病变部位，但也可累及结肠，引起痢疾样症状。
