本病并发症较少见。可并发脑膜脑炎，脑脊液内可找到微丝蚴。服用乙胺嗪后，垂死的微丝蚴可阻塞大脑毛细血管。引起持续性昏迷。此外，还可发生丝虫病性心功能不全，心包炎，心肌炎，心内膜炎，热带性肺嗜酸细胞浸润症，蛋白尿甚至血尿等。