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颅底凹陷症平时预防,主要是注意女性孕期,围生期保健防病及不能随意用药,防止先天性畸形儿的出生。多以清淡食物为主,注意饮食规律。原发性颅底凹陷症常合并其他畸形,如扁平颅底,中脑导水管闭锁,小脑扁桃体下疝畸形,脑积水,延髓和脊髓空洞症等,继发者有骨软化症,佝偻病,成骨不全和类风湿性关节炎等临床表现。