GER原临床表现多样，轻重不一，有些症状较典型，如烧心和反胃，有些症状则容易混淆，无特征性，从而忽略了对本病的诊治。多数患者呈慢性复发过程。其临床表现可分为四组，即：①GER症状，如反胃，反酸;②由于反流物刺激食管引起的症状，如烧心，胸痛，吞咽时胸痛;③食管以外的刺激症状，如咳嗽、气喘及咽喉炎等症状;④并发症症状。
1.烧心和反酸 是GER最常见的症状。胃内容物在无恶心和不用力的情况下涌入口腔统称为反胃，反流物中偶含少量食物，多呈酸性或带苦味，此时称为反酸。反酸常伴有烧心。烧心指胸骨后烧灼感或不适，常由胸骨下段向上伸延。常在餐后1h出现，尤其在饱餐后。平卧、弯腰俯拾姿势或用力屏气时加重，可于熟睡时扰醒。
2. 咽下疼痛与咽下困难 炎症加重或并发食管溃疡时，可出现咽下疼痛，多在摄入酸性或过烫食物时发生。部分患者有咽下困难，呈间歇性，进食固体或液体食物均可发生，每发生在开始进餐时，呈胸骨后梗塞感，可能是由于食管痉挛或功能紊乱所致。少部分患者发生食管狭窄时则呈持续性咽下困难，进行性加重，对干食尤为明显。
3.胸骨后痛 常有位于胸骨后的烧灼样不适或疼痛，严重时可为剧烈刺痛，可向剑突下、肩胛区、颈部、耳部及臂部放散，酷似心绞痛。多数患者由烧心发展而来，但仍有部分胃食管反流病患者无烧心反酸等典型症状，尤应注意鉴别。
4.其他 有的患者表现为咽部不适有堵塞感，但无真正的吞咽困难，称为癔球症，是由于酸反流引起上食管括约肌压力升高的缘故。重症反流性食管炎因反流物吸入，可导致慢性咽炎、声带炎嘶哑、哮喘发作或吸入性肺炎。
