1.尿液检查 有少量红细胞、脓细胞、蛋白及管型。高倍镜下可见到革兰阳性“Y”形分枝菌。
2.脓液检查 在从窦道流出的脓液或肾周围脓肿穿刺所抽出的脓液中可查到灰黄色的菌落颗粒，称为“硫黄颗粒”。颗粒呈圆形或椭圆形，中心颜色淡，排列呈放射状，这是放线菌病最具特征性的改变。
1.影像学检查 B超或IVU可见肾肿大、肾盂变形、肾盂破坏，似有占位病变。增殖型的病变可见肾盂肾盏呈蜘蛛脚样变形。
2.组织学检查 病变难以鉴别时，可取活组织做病理检查。同时，应与相应器官的肿瘤或其他感染性疾病相鉴别。
3.膀胱镜检查 可见膀胱内黏膜红肿、充血等慢性炎症性改变。活组织检查见到典型的颗粒状菌落，可明确诊断。