由于引起慢性腹泻的病因多种多样，为了解其原因应当详细询问病史，认真仔细查体，做一些必要的化验或特殊检查，如纤维结肠镜、X线钡餐透视、钡灌肠、CT、B超等，以便做好鉴别，做出正确诊断，进行合理的治疗。
1.体征
(1)腹部：胀气、腹块、压痛、肠鸣音、蠕动波、肛门指检。
(2)全身症状：体温、脱水、营养状况、贫血、恶液质、淋巴肿大等。
(3)皮肤：黄疸、潮红、结节性红斑、出血倾向、色素沉着、毛细血管等。
(4)五官：虹膜炎、突眼、口炎。
(5)心脏：三尖瓣、肺动脉瓣病变。
(6)神经肌肉骨骼：震颤、周围性神经病、步态、关节炎。
2.实验室检查和特殊检查
(1)粪便：常规检查可初步确定有否炎症。Wright染色观察白细胞对急性腹泻性质有助，仅毒素作用于黏膜者无白细胞;碘染色查阿米巴包囊，苏丹 (sudan)Ⅲ染色可发现90%的脂肪泻。致病菌培养是诊断细菌感染的关键。24h大便重量、大便电解质及渗透压测定有助于分泌性及渗透性腹泻的鉴别。
(2)放射学检查：腹部x线平片对胰腺钙化、局限性肠充气有助;钡餐对慢性腹泻有重要提示，而钡灌肠对炎症性肠病有特殊价值。
(3)内镜检查：急性腹泻一周内勿常规做结肠镜检查，慢性结肠性腹泻者应常规做乙状结肠镜检查;全结肠镜可达回肠末段20～30cm，对回、结肠病变可直接观察及提供活检标本;小肠镜及活检对部分病例也特别重要。如麦胶病时的黏膜萎缩，Whipp-le病时PAS染色阳性的巨噬细胞。
(4)有关吸收不良的检查
①粪脂定量测定。患者每日摄入100g脂肪。连续3d，测定粪便脂肪，每日排出量6g以上或脂肪吸收率小于90%时示吸收不良。
②右旋木糖吸收试验。摄入5g木糖，5h小便排出lg以上，或2h血中不少于lmg;低血及尿木糖水平提示肠黏膜病变如麦胶病。
③乳糖耐量试验。给50g乳酸，测定2h血糖浓度，正常人应提高20μg/dl，乳糖酶缺乏者低于此值。
④维生素B12吸收试验。口服同位素标记的维生素B12,测定小便排出量，正常人24h为口服量的7%;回肠病变、回肠切除者或小肠细菌增长者下降。
(5)小肠黏膜活检：通过内镜将小肠黏膜活检送病理检查。亦有经口插入小肠活检管吸取小肠黏膜做病理检查者，以确定诊断。
(6)血清胃肠道激素测定：胃泌素瘤、类癌综合征、胰原性霍乱及甲状腺髓样癌等可致腹泻。为此，可进行血清钙素、降钙素、肠血管活性肽、5-羟色胺及尿中5.羟吲哚乙酸(5-HIAA)测定。
(7)其他：根据情况可做糖耐量试验，测定双糖酶、进行十二指肠液细菌培养，找梨形鞭毛虫等。
