过去100多年来，关于RT病因有几种假说：甲状腺内源性假说，药物致病假说，基因假说和自身免疫假说等。其中自身免疫假说被认为是RT最有可能的病因[2]，其原因：1)部分RT患者中可检测到甲状腺自身特异抗体;2)RT常和其他器官的自身免疫性疾病有关(桥本甲状腺炎、Graves病、恶性贫血等);3)33% RT患者10年内可发生其他部位的纤维化疾病;4)对糖皮质激素治疗敏感;5)对三苯氧胺治疗敏感。
甲状腺纤维化过程尚未完全明了，在这一自身免疫性反应引起的纤维化过程中，可能涉及许多与淋巴细胞、浆细胞活动，纤维原细胞增殖，细胞外基质积聚等有关的细胞因子。