与多形性腺瘤、腺淋巴瘤相鉴别。

乳头状囊腺瘤的临床表现与多形性腺瘤相类似，缺乏特征表现，故临床上常诊断为多形性腺瘤。腮腺造影可显示为良性征或具有局部侵润性的良性肿瘤。B超检查时在声像图上亦可表现为“网格状”结构，易与腺淋巴瘤相混淆，但腺淋巴瘤的边界回声清楚，而乳头状囊腺瘤较模糊。