1. 三叉神经痛可并发脑神经损害，如面部轻瘫等。
有相当一部分三叉神经痛患者常揉擦同侧面部以求减轻疼痛，久而久之面部皮肤变得粗糙、增厚和眉毛脱落。有少数患者出现跳动、抽搐，也有伴有面部潮红、流泪、流涕、出汗，高血压等症这是三叉神经痛的并发症之一。
2. 三叉神经痛可并发半侧面部痉挛。
对不典型疼痛者，外科治疗无效，有时导致抑郁症。三叉神经支配区也可发生不典型的面部疼痛，但疼痛的性质与三叉神经痛不同，每次发作的持续时间总是长于数秒，通常为数分钟，或呈持续性疼痛。疼痛本身为钝性、压榨性或烧灼样。
3. 三叉神经痛可并发面部感觉障碍。
大多数患者治疗后可有不同程度的面部感觉障碍。在Menzel总结的315例中，治疗后大约93.1%患者面部有不同程度的麻木感或烧灼感。
4. 三叉神经痛可并发角膜炎。
半月神经节热凝术的一个较为严重的并发症就是出现角膜反射消失，严重者可引起麻痹性角膜炎，最终可导致患者失明。有的角膜反射消失后需数个月才逐渐恢复。
5. 三叉神经痛可并发颅内出血。
半月神经节内侧邻近海绵窦和颈内动脉，穿刺不慎或进入卵圆孔过深易损伤而出血，严重者可形成颅内血肿。
6. 三叉神经痛可并发颅内感染。
开颅手术治疗严格无菌操纵可防止颅内继发感染。但是如果反复穿刺时穿刺针穿破颊黏膜将口腔内细菌 带入颅内，会引起颅内感染。