肾积水一旦并发感染，若梗阻不及时解除，感染难以治愈，感染又加速肾脏的破坏，形成恶性循环，甚至形成脓肾。
一、尿路感染因尿滞停于肾、输尿管内，致使细菌生长繁殖，从而并发肾盂肾炎、输尿管炎、膀胱炎或肾周围炎等。
二、肾萎缩：肾萎缩是肾积水引起的主要危害。由于尿排受阻，肾盂扩大，肾内压增加，肾组织血管受压，导致肾缺血性进行性萎缩、破坏，肾功能受损。更严重时肾就会变成无功能的大囊袋。轻度肾积水患者，当解除肾积水梗阻后，肾盂形态还可复原;而重度肾积水，萎缩的肾组织就难以修复了。
三、肾结石形成：结石阻塞尿道并发肾积水，肾积水又诱发结石形成，两者互为因果。感染的菌群、脓球、坏死脱落的组织细胞成为肾结石形成的核心，特别是感染的尿内盐晶析出会堆积成石。
四、重度肾积水因肾实质很薄，如果肾内张力过大，就容易引起外伤性破裂或自发性张力性破裂，可能并发急性腹膜炎，严重威胁生命安全。