胃结核应首选抗结核药物治疗，发生并发症或诊断困难时可考虑手术治疗。
1.抗结核药物治疗 抗结核药物对大多数胃结核患者疗效良好。常用的治疗方案为异烟肼300mg加利福平600mg，1次/d，口服，共9个月。亦可前2个月每天服1次，后7个月改为每周服2～3次。对耐药者可加用吡嗪酰胺、链霉素或乙胺丁醇。对轻症患者可选用异烟肼加乙胺丁醇治疗18～24个月，前2个月可加用链霉素。用药过程中应注意监测药物的副作用。
抗结核治疗后，溃疡性病变能完全愈合，幽门梗阻者亦能缓解。Gupta等报道1例胃结核幽门梗阻如针孔大小，治疗8～12周时呕吐消失、18个月时胃镜已能顺利通过幽门进入十二指肠。
2.手术治疗 手术适应症为幽门梗阻、急性穿孔、局限性穿孔伴脓肿或瘘管以及大出血。目前主张手术方式应尽量保守、简单。如需要胃切除者;可行BillrothⅡ式手术，因结核可侵及十二指肠，不宜作Billroth Ⅰ式手术。术中肉眼判断病变性质有困难时，应行冰冻切片检查，以免误诊为恶性肿瘤而进行广泛切除，或认为肿瘤晚期而放弃手术。手术前后联合应用抗结核药物，以防病变扩散。