1.末梢血白细胞计数及中性粒细胞可增多，血沉常加快，大便镜检可见白细胞和红细胞。
2.从病变部位留取标本如大便、血、尿、痰、脑脊液、肠系膜淋巴结等均可分离出耶尔森菌。
3.血清学检查 ①恢复期血清凝集试验较急性期效价呈4倍以上增长或滴度1∶160以上有诊断意义。②血清抗耶尔森菌外膜蛋白IgA，IgG检测较凝集试验特异性更强。
4.其他可用免疫荧光法检测活检标本中的耶尔森菌抗原，以常规PCR方法检测临床及食物标本中小肠结肠炎耶尔森菌和假结核耶尔森菌以及PCR-探针相结合方法、Nested-PCR方法检测小肠结肠炎耶尔森菌。