反复发作的肺炎链球菌脑膜炎应与Mollaret脑膜炎鉴别。Mollaret脑膜炎为一种病因不明的少见病，以良性复发为特点。青少年多见发病年龄最小者5岁。表现为发作性发热、头痛、呕吐、颈强直、克氏征与布氏征阳性。有时伴癫痫大发作、晕厥、昏迷，一过性视力、语言障碍，暂时性面瘫、复视、瞳孔不等大等。症状多突然发作，数小时达高峰。每次持续时间短暂，约3～7天后症状突然消失，2次发作期间无任何异常。脑脊液呈脓性，蛋白增高，糖轻度减少，白细胞明显增多，瑞染色见大单核样细胞即Mollaret细胞，该细胞体积约为正常单核细胞的4～5倍，细胞膜不清，胞浆多呈灰色，有空泡无颗粒，细胞核折叠有凹陷，部分有分叶，无核仁。1～2天后脑脊液即以淋巴细胞为主。细菌、真菌、病毒检查均为阴性。Mollaret细胞大量检出是诊断本病的重要依据，但须与瘤细胞鉴别。天津儿童医院曾于1980年报告1例13岁女童，在4年半中反复发作7次。