1.与原发性心脏肿瘤相鉴别 后者发病率极低，仅为前者的1/20，发病年龄较小，以良性心脏黏液瘤多见。无心外恶性肿瘤病灶是主要的鉴别依据。
2.与扩张型心肌病鉴别 两者均可表现为充血性心力衰竭，检查表现为心脏扩大和活动度降低。但心脏转移瘤发展较快，对洋地黄及利尿药治疗效果差，X线片可见心脏外形不规则,B超、CT及磁共振可发现肿瘤病灶。
3.与其他原因的心包积液鉴别 前者多为血性，发展快，积液中可找到癌细胞，治疗效果差。
此外，本病并发的心律失常及ST-T的改变应与其他疾病引起者区别，心脏包块和原发肿瘤是鉴别的关键。