1.尿液常规检查
(1)尿液采集 新生儿尿培养尿标本采集的常用方法有集尿袋和导尿法。
(2)尿液常规检查 尿液沉淀后沉渣镜检，如白细胞>10个/高倍视野，或不离心尿标本的镜检，白细胞>5个/高倍视野，即应考虑为泌尿系感染。如尿中有管型尤其颗粒管型，提示肾实质已受损。
2.尿液直接涂片找菌
混匀的新鲜尿，若在油镜下每个视野能找到1个以上细菌，表明尿内细菌在10万/ml以上，有诊断意义。
3.尿培养及菌落计数
是确诊的重要依据。方法是用耻骨上膀胱穿刺术采取尿标本，尿液采取后立即做细菌培养，若有细菌生长即可诊断。
4.其他检查
对新鲜尿标本进行床边试验有助于诊断：脓尿(男孩>10个白细胞/µl，女孩>50个白细胞/µl)有较好的阴性预测价值，亚硝酸盐还原试验有较好的阳性预测价值。若亚硝酸盐试验、白细胞酯酶过筛试验及清洁尿液的显微镜检查均为阴性结果，可以完全除外尿路感染。