遗传因素可能是多指(趾)或并指(趾)先天畸形最主要的发病原因，除此之外，孕前工作环境、孕母年龄、孕早期膳食、环境因素、家庭经济状况与子代多指(趾)并指(趾)先天性畸形有关。因此，多指(趾)并指(趾)先天性畸形的预防既要考虑遗传因素，又要考虑环境因素的作用和影响。
目前认为母亲年龄过小(14～19岁)而怀孕生产是多指(趾)并指(趾)的危险因素，妊娠期合并糖尿病将增加胎儿患多指(趾)和(或)并指(趾)的危险。孕母改善膳食对预防多指(趾)和(或)并指(趾)有一定作用。膳食中水果类摄入频率较低将增加胎儿患多指(趾)的风险，孕早期多吃肉、蛋类将减少胎儿多指(趾)并指(趾)患病风险。还有研究从卫生经济的宏观角度指出年人均收入高的家庭能减少胎儿患多指(趾)并指(趾)的风险，有宏观研究报道多指发生率与家庭收入呈负相关，其原因可能也与这些家庭更重视卫生保健有关。