扁桃体鳞状细胞癌可采用外科手术或放疗。外科手术偶尔可经口腔入路完成，但必须保证有充足的游离切缘。早期病变通常行唇正中及下颅骨前正中或一侧的联合切除;如病变侵及下额骨浅层，应采用下颅骨部分切除，其中包括能保留下领骨体和下颌骨升支连续性的帽状切除。对早期病变，单纯切除扁桃体无效，联合切除可能有效，但可造成严重的功能障碍及外形缺损，因此极少采用。鉴于大部分扁桃体癌分化较差，对放疗较敏感，早期病变治愈率较高、T1和T2病变首选放疗。
伴有舌根、软腭和口咽侧壁受侵的扁桃体癌晚期病变(T3和T4)单纯放疗难以治愈，晚期病变的手术切除后复发率高达50%一70%，因此，对晚期病变应用综合治疗。现在倾向于原发灶单纯放疗.颈部行手术治疗。首先采用缩野技术行高剂量的外照射，随后对舌根和邻近下颌骨病灶行手术切除。对有手术指证的病变，先采用联合切除及组织瓣修复，然后给予高剂量放疗，任何颈部放疗后的残存病变.均呵手术切除。
Bcehar等用外照射、组织间插植加颈淋巴结清扫(主要为N2和N3期病变)治疗37例扁桃体癌和软腭癌患者.95%局部得到控制，87%的患者颈部得到控制，实际5年生存率为64%。
比Leborgnc分析了140例扁桃体癌的治疗情况，外照射加间质治疗较单纯外照射局部控制率高。由此认为，侵及舌根的t3病变，加以放疗为主.应加间质治疗。T3病变，单纯外照射效果不理想.选择性地增加间质治疗可提高疗效，手术加放疗的综合治疗同样合效。
扁桃体鳞状细脑癌是口咽癌的常见肿瘤，易与磨牙后三角和咽前柱癌相混淆，后考由于其生长、扩散、预后及治疗方法类似于口腔癌，故归为口腔癌。
扁桃体癌放疗治愈率高，中期病变(T2N0和T2N1)单纯放疗，3年无病生存率为60%-0%。不同于口腔癌，其早期淋巴结转移不影响生存中。放疗对颈部转移淋巴结有较高治愈率，仅有不足10%的患者死于颈部治疗失败，大部分由于原发灶无法控制，尤其是T3和T4期病变;单纯死于远处转移的患者约有7%.
考虑到患者术后的整形费用，对根治性放行后病早灶的挽救手术应慎重考虑。约1/3的患者残存病灶手术后，病理显示无肿瘤存在。放疗应积极采用缩野技术加量，对避免术后并发症有重要意义。
有计划的放疗和外科手术的综合治疗对晚期T3和T4期病变有重要作用。大部分专家的经验为局限高剂量的术前放疗后残存病灶采用局限于术切除。随着整形技术的发展，越来越多的患者先用根治性切除术，随后给予高剂量治疗(55-60Gy)，而无明显的并发症出现。较大的病变往往伴有颈淋巴结转移，用单纯放疗或手术治疗均无法治愈，化疗或故疗仅起某些姑息减症作用。