根据肠痉挛的评分结果决定治疗，评分参照哭吵的强度和持续时间、伴随症状、父母对孩子哭吵的看法。如果哭吵与肠痉挛有关，但哭吵不剧烈者用第一、第二级治疗方案;如果是严重肠痉挛者，采用第三级治疗方案。
1.第一级治疗
给孩子抚慰，摇动孩子，减低环境噪音，用热水袋捂婴儿腹部;对家长给予支持和关心;服用二甲基硅油。二甲基硅油是种非吸收性药物，通过改变气泡表面张力，使气泡融合或弥散，促进气体排出，对人体无副作用。其他减少肠道气体的药物，如活性碳、α-半乳糖苷酶能吸附气体或帮助消化高纤维素食物，减少发酵产气，但目前对肠痉挛的疗效尚不肯定。
2.第二级治疗
即药物治疗。可用解痉药(如西托溴铵)阻断平滑肌的毒蕈碱型受体，还可直接作用于平滑肌，解除平滑肌痉挛。
3.第三级治疗
改变饮食和(或)药物治疗。哺乳妇女不食用牛奶、奶制品、鱼和蛋;人工喂养儿给予豆奶或水解酪蛋白的奶方，能明显改善婴儿肠痉挛。对于CMPI引起的肠痉挛者，去除牛奶蛋白，改用豆奶或水解蛋白后，71%-88%的患儿症状缓解。药物治疗(如盐酸双环胺)有一定的副作用，有时疗效不理想，饮食改变可能比用药更适宜。
