硬脊膜外脓肿应与下列疾病鉴别：
1.急性脊髓炎 常无原发化脓感染史，体检无局限性棘突叩击痛或压痛，腰背痛也不明显。一般在发病后3天内病变节段以下肢体即完全瘫痪，脊髓蛛网膜下腔没有阻塞。
2.脊柱转移癌 常可找到原发癌肿，如肺、乳腺、前列腺或消化道等肿瘤，X线片可见到“手风琴”样椎体压缩和破裂。
3.蛛网膜炎 一般起病缓慢，症状时轻时重，感觉障碍分布常不规则，且不能以单节段损害来解释其全部症状;椎管造影时碘油流动缓慢、分散，成不规则的点滴状、条状或片状阴影，碘油受阻端的边缘不整齐。
4.椎管内肿瘤 常无感染史，必要时可作椎管碘油造影或脊髓MRI检查，手术探查亦可区别之。
5.脊柱结核 有肺结核或身体其他部位结核病史，腰背痛和低热症状历时较长，脊柱可有后突畸形，X线片可见骨质破坏和椎旁冷脓肿阴影等，CT和MRI也有助于鉴别诊断。
6.急腹症和其他疾患(如肋间神经痛等) 仔细询问病史和检查，不难加以鉴别。