1.血常规检查 见白细胞总数减少，伴中性粒细胞减少。也可随后出现白细胞总数增多。
2.病毒分离 病毒分离是HHV-6、7型感染的确诊方法。HHV-6、7型可在新鲜脐血单核细胞或成人外周血单核细胞中增殖。但需在培养基中加入植物血凝素 (PHA)、IL-2、地塞米松等物质。感染细胞在7天左右出现病变，细胞呈多形性、核固缩、出现多核细胞。感染细胞出现病变后还可继续生存7天，未感染细胞则在培养7天内死亡。由于病毒分离培养费时，不适于早期诊断，一般只用于实验室研究。
3.病毒抗原的检测 病毒抗原检测适于早期诊断，但病毒血症维持时间短，很难做到及时采取标本。目前广泛采用免疫组化方法检测细胞和组织内病毒抗原。抗原阳性结果可作为确诊的依据。
4.病毒抗体的测定 采用ELISA方法和间接免疫荧光方法测定HHV-6、7型IgG、IgM抗体，是目前最常用和最简便的方法。IgM抗体阳性，高滴度IgG以及恢复期 IgG抗体4倍增高等均可说明HHV-6、7感染的存在。当从脑脊液内测到IgM抗体或IgG抗体时，提示中枢神经系统感染的存在。IgM抗体一般产生于感染后5天，可持续存在2～3周，IgG抗体于感染后7天产生，4周后达高峰，可持续长时间。但由于疱疹病毒之间存在一定抗原交叉，其他疱疹病毒感染也可引起抗体增高，可用抗补体免疫荧光试验加以鉴别。
5.病毒核酸检测 采用核酸杂交方法及PCR方法可以检测HHV-6、7 DNA。由于HHV-6、7均存在潜伏感染，因此有时检测出病毒的DNA，并不能确定处于潜伏状态或激活状态。可用定量、半定量PCR来测定DNA的量，来明确是否存在活动性感染。高浓度的病毒DNA提示活动性感染的存在。
对HHV-6、7感染的诊断，应结合临床表现及多项病因学检查结果进行综合判断。
一般病例无需特殊检查，必要时可做X线胸片、心电图等检查。