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并发症多见,大部分与原有的多种基础疾病有关,年轻人以及体质好的病人并发症少。老年人以及体质低下,特别是重症病人(带有气管插管、呼吸机辅助呼吸的病人)并发症较严重可有:休克、败血症、脓毒血症、心律失常、水电解质紊乱、酸碱失衡、呼吸衰竭、心力衰竭、多器官功能性衰竭等,严重还可并发心肌脓肿。并发症出现后,病情重,进展快,死亡率高。故一旦确诊厌氧菌感染应进行积极的治疗。