男性早上起来腰疼可能由多种原因引起，比如不当睡姿、肌肉或韧带拉伤、肾炎、椎间盘突出症、骨质疏松等。
1.不当睡姿：睡眠过程中，如果长时间保持不良姿势，如过度扭曲身体、趴着睡等，会使腰部肌肉处于紧张状态。在这种状态下，肌肉无法得到充分的放松和休息，经过一夜的持续紧张，早上起来就容易出现腰疼。
2.肌肉或韧带拉伤：日常活动中，如果进行了过度的体力劳动、剧烈运动或不正确的运动姿势，都可能导致腰部肌肉或韧带拉伤。受伤后的肌肉或韧带在夜间休息时可能会出现炎症反应，导致疼痛加剧，早上起床时疼痛更加明显。
3.肾炎：肾炎是一种肾脏疾病，可引起腰部疼痛。当肾脏发生炎症时，肾脏组织会肿胀，刺激周围的神经和组织，导致腰疼。这种疼痛通常为隐痛或钝痛，可能伴有尿频、尿急、尿痛等泌尿系统症状。
4.椎间盘突出症：腰椎间盘是连接相邻两个腰椎椎体的软骨盘，由髓核、纤维环和软骨板组成。椎间盘发生退变、损伤或受到外力作用时，髓核可能会突出，压迫周围的神经组织，引起腰疼。
5.骨质疏松：骨质疏松会使骨骼变得脆弱，容易发生骨折和疼痛。早上起来腰疼可能是由于夜间睡眠时，身体长时间保持同一姿势，腰部骨骼承受的压力不均匀，导致骨质疏松的部位出现疼痛。
男性早上起来腰疼可能是由多种因素引起的，保持良好的生活习惯和适当的体育锻炼，避免长时间的不良姿势，有助于预防腰部疼痛的发生。如果疼痛持续或加重，应及时就医，以免延误治疗。