瘴疟（昏疟）发病的症状有：寒战、发热、体温高达39C以上，出汗，肌肉酸痛，头痛剧烈，持续2～6小时缓解，然后病人再度突然发作，寒战和发热交替出现，持续数小时，一日可发作数次。
如有肺型发作，可见剧烈咳嗽，胸闷，气急，肺内湿啰音。
如有脾脏肿大的症状，则可见到左上腹剧痛，食少、腹胀、便秘等症状。
如有心型发作，则可见心慌、气促、心前区痛、肝脾肿大等症状。
如有胃肠型发作，则可见恶心、呕吐、腹痛、腹胀、肝脾肿大等症状。
如有厥型发作，则可见突然昏倒、四肢抽搐、口吐白沫、神志不清等症状。
如有波型发作，则可见长期低热、全身不适、头痛、骨关节疼痛、体重减轻等症状。