新生儿结肠炎是由于肠道内细菌失衡引起的。具体原因如下：
1. 胎儿期感染：母体在怀孕期间感染某些病毒或细菌，可通过胎盘传递给胎儿，导致胎儿肠道内细菌失衡。
2. 分娩方式：剖宫产和阴道分娩对新生儿肠道菌群的影响不同，剖宫产新生儿肠道内的细菌种类和数量较少，易导致肠道菌群失衡。
3. 喂养方式：母乳喂养可促进肠道内有益菌群的生长，而人工喂养则容易导致肠道内细菌失衡。
4. 抗生素使用：新生儿因各种原因需要使用抗生素时，会破坏肠道内的细菌的平衡，导致肠道菌群失衡。
5. 免疫力低下：新生儿免疫系统尚未完全发育，免疫力较低，易受到细菌感染。
综上所述，新生儿结肠炎是由于肠道内细菌失衡引起的，原因包括胎儿期感染、分娩方式、喂养方式、抗生素使用和免疫力低下等。