咽喉炎是由病毒或细菌感染引起的炎症，打两针可能是指两针抗生素治疗。然而，咳嗽持续可能是因为以下原因：
1. 抗生素可能对病毒无效，如果咽喉炎是由病毒引起的，抗生素治疗可能不会有效。
2. 抗生素可能无法彻底清除细菌，如果细菌感染比较严重，两针抗生素治疗可能不足以彻底清除细菌。
3. 咽喉炎可能引起气道炎症，导致咳嗽持续。即使细菌或病毒感染已经得到控制，气道炎症仍然可能导致咳嗽。
4. 患者可能存在其他健康问题，如哮喘或过敏反应，这些问题可能导致咳嗽持续。
因此，如果咳嗽持续不止，建议患者咨询医生以确定原因并寻求适当治疗。