肉毒素注射打腋臭一般不会很痛。肉毒素是通过注射进入肌肉来抑制神经信号的传递，从而减少腋臭的产生。但有些人在注射时可能会感到一些刺痛或不适感。
原因如下：
1. 注射时的针头刺入皮肤和肌肉组织可能会导致一定的疼痛感。
2. 肌肉注射时，注射液的温度和药物成分可能会引起一些刺激感。
3. 个人的疼痛耐受程度会对感受到的疼痛程度产生影响。
然而，这种疼痛感通常是短暂的，注射过程很快就结束了。如果注射过程中的疼痛感过于强烈或持续不退，建议立即告知医生。总体而言，肉毒素注射打腋臭的疼痛程度相对较轻，大多数人能够耐受。