肺脓肿后期的治疗主要是通过抗生素治疗来控制感染。具体的药物选择和治疗方案需要根据患者的具体情况而定，一般需要根据病原菌的敏感性进行选择。
常用的抗生素药物包括青霉素、头孢菌素、氨基糖苷类、喹诺酮类等。这些药物可以通过杀死细菌或阻止其生长来控制感染，从而减轻炎症反应和症状。
除了抗生素治疗，还需要对症治疗，如使用退烧药、止咳药等来缓解症状。此外，对于病情较重的患者，可能需要进行氧疗或机械通气等支持治疗。
总之，肺脓肿后期的治疗需要综合考虑患者的具体情况，通过合理的药物治疗和对症治疗来控制感染和缓解症状，从而促进患者的康复。