甲状腺囊肿手术疤痕不愈合可能是由以下原因引起的：
1.手术切口感染：手术后切口没有得到很好的清洁和消毒，导致感染，影响疤痕愈合。
2.手术切口张力过大：手术后切口周围的张力过大，导致疤痕不能愈合。
3.手术切口缝合不当：手术后切口缝合不当，导致疤痕不能愈合。
4.患者自身免疫力低下：患者自身免疫力低下，导致疤痕不能愈合。
针对这些原因，可以采取以下措施：
1.加强手术切口的清洁和消毒，避免感染。
2.手术后适当减轻切口周围的张力，避免影响疤痕愈合。
3.手术切口缝合时要注意缝合技巧，确保切口缝合得当。
4.患者术后应注意休息，加强营养，提高免疫力。
如果疤痕仍然不能愈合，建议及时就医，进行进一步检查和治疗。