肋骨骨折咳嗽疼痛的原因是因为肋骨骨折后，肋骨周围的软组织和神经受到了损伤，当进行咳嗽等活动时，肋骨和周围的组织会受到牵拉和挤压，从而引起疼痛。此外，咳嗽本身也会导致肋骨骨折的疼痛加剧，因为咳嗽会增加胸腔内的压力，使肋骨更加受到挤压和牵拉。因此，在肋骨骨折后，应尽量避免咳嗽等活动，以减轻疼痛。
