灰指甲往往是先患上手癣或脚癣，真菌首先入侵甲周围的皮肤，然后经过指甲或趾甲的发育演变，渐渐入侵甲板内，并更进一步繁衍，直至破坏整个甲板。若是真菌入侵甲根部，影响了甲的滋长，便可引发甲发育不完善或甲畸形。
一般说来灰指甲病变的过程是相比缓慢的，而更多的情形下灰指甲的发生是因为指甲因外伤或常常搔抓而造成破损后感染真菌而引发的。例如说患者有脚癣或股癣，因为瘙痒难忍常用手指甲搔抓，这一来手指甲上会沾上很多病损中的真菌。长时期反复搔抓摩擦，指甲极有可能有破损，从而使真菌趁虚而入引发灰指甲。
专家指出，真菌引发的灰指甲能够出现多样颜色，最多见的是灰白色，还可看见褐色、灰褐色或深褐色。灰指甲病变始于甲远端、侧缘或甲褶部，表现为甲颜色和形态异常。一般以1-2个指(趾)甲开始发病，重者全部指(趾)甲均可罹患。患病甲板失去光泽，日久甲板变脆而破损脱落。甲板增厚显著，表面高低不平。其质松碎，甲下常有角蛋白及碎屑沉积。有时，甲板可与甲床分离。有些还能够伴随甲沟发炎，局部红肿作痛。
甲沟炎是指（趾）甲周围软组织的化脓感染,是细菌通过甲旁皮肤的微创破损袭至皮下并生长繁殖引起.在手指,多由于刺伤,撕剥肉刺或修剪指甲过深等损伤引起.在足趾,多因嵌甲或鞋子过紧引起,大多发生在拇指.
甲沟炎多见于青少年或妇女.一般它可发生于手指,或者发生在足趾,发于手指者常有啃手指的不良习惯,发于足趾者常由嵌甲继发感染引起.在足趾,多因嵌甲或鞋子过紧引起,大多发生在拇指.
甲沟炎初起未成脓时,局部可选用鱼石脂软膏,金黄散糊等敷贴或超短波,红外线等理疗,并用R复方新诺明等抗菌药.已成脓时,除了用抗菌药,应行手术处理.对单侧的皮下脓肿,可在甲沟旁切开引流；双侧皮下脓肿则需双侧引流.甲根处的脓肿,单纯掀起皮肤往往难以充分引流甲下脓液,需要分离拔除一部分甚至全片指甲(但不可过于损伤其基底组织,以免失去日后指甲再生能力).麻醉应在指的近端以利多卡因阻滞指神经.不可在病变邻近处行浸润麻醉法.
儿童与灰指甲患者长期接触而不注意防范，真菌很容易传给儿童致使感染脚气或灰指甲等真菌病。如家庭成员中有患灰指甲、脚气等真菌病的患者，应尽早治疗，以此同时，家庭清洁用品应分开使用清洗，以免把真菌传染给其他家庭成员特别是家中小孩。
儿童易感染灰指甲的其中一个重要原因在于，由于儿童玩性较大，对很多事物都充满好奇，加之他们通常不明白良好的卫生和洗手的重要性，卫生意识比较薄弱，在玩耍的过程中指甲容易出现真菌，指甲可以说是儿童的身体最脏区域之一.指甲底部寄存许多细菌，特别是如果他们留有长指甲。家长应时刻注意小孩的卫生，勤于洗手，定期给小孩修剪指甲，在修剪指甲的过程中应避免指甲修剪过深或是剪破。
此外，儿童的免疫系统发育不够成熟，功能尚欠完善，免疫力相对于成年人较低下，因此是易感人群，这种情况下比较容易被真菌侵入甲板周围皮肤或甲下组织，然后分泌角质蛋白酶分解角质，破坏甲组织而引发感。
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