细菌性阴道炎能治根，这是一种常见的妇科疾病，以药物治疗为主，可以口服药物或者外用药物治疗。药物治疗可分局部用药、全身用药，一般细菌性阴道炎通过规范性的用药治疗后，可得到恢复，孕妇可以口服药物治疗，一般患者可以局部用药治疗。
1.局部用药治疗
细菌性阴道炎的局部用药治疗方法，常用药物是有克林霉素软膏、甲硝唑阴道栓、替硝唑栓等，一般外用在阴道处。也可以进行阴道内用药，可以使用乳酸杆菌栓剂，能改善阴道内部的酸度，抑制住厌氧菌，对细菌性阴道炎会起到良好的效果，用药过程需要严格按照医嘱进行。
2.全身用药治疗
治疗细菌性阴道炎，可以采取全身用药方法，比如克林霉素、甲硝唑等药物，适用于有症状的患者以及妊娠期，在妊娠期合并细菌性阴道炎，可以口服药物治疗，对于哺乳期的患者可以局部用药治疗。克林霉素一般适用于妊娠期患者，对甲硝唑不耐受的患者也适用，甲硝唑是比较常见的治疗药物，能改善阴道炎症状。
3.抗厌氧菌药物
细菌性阴道炎一般做积极治疗，是可以治根的，药物治疗采用抗厌氧菌药物，用药方式包括有口服、外用栓剂、软膏等。对于存在复发情况的患者，可以选择不同的抗厌氧菌药物治疗，也可使用阴道乳杆菌制剂来促使阴道内部的微生态平衡，病情比较严重的，可以延长治疗时长。