主要采用内分泌激素治疗，治疗方法因人而异。下丘脑和垂体激素治疗仅限于生长激素和ACTH，LRH主要用于下丘脑性性功能减退，大多数患者采用靶腺激素替代治疗。
1、补充肾上腺皮质激素最为重要，且应先于甲状腺等激素的治疗，以免诱发肾上腺危象。首选药物为可的松，而可的松、泼尼松等制剂均需经肝脏转化为氢可的松而见效。剂量须视病情而个体化，较重病例可给全量补充，即每日约30mg（相当于可的松37.5mg，泼尼松7.5mg），服法应模仿生理分泌，故每日上午8时前服2/3，下午2时服1/3较为合理，随病情调节剂量，过量时易致欣快感，失眠等精神症状。如有感染等应激时，应该加大剂量。
2、补充甲状腺激素须从小剂量开始，以免增加代谢率而加重肾上腺皮质负担，诱发危象。
3、补充性激素育龄女性，病情较轻者需采用人工月经周期治疗。
