慢性阻塞性肺疾病、肺癌及职业性肺病是与大气（室内）空气污染密切相关的疾病，控烟、减少大气污染是预防这些疾病发生发展的关键。我国烟草生产量占世界首位，吸烟人数占人口比例为世界最高的国家之一。宣传吸烟有害，在全国取缔烟草广告，并采取切实有效的措施戒烟，是当前的重要任务；同时由于我国大部分城市空气污染严重（包括二氧化硫、降尘、氮氧化物含量远远超标），必须严格执行国家环保部门制订的空气污染容许标准。改造工业及家用燃料，将工业废气及室内空气污染降至联合国世界卫生组织规定的标准（或以下）。对于SARS、禽流感之类的急性呼吸道传染性疾病，要按照《中华人民共和国传染病防治法》法定传染病进行管理，针对传染源、传播途径、易感人群三个环节，采取管理传染源，预防控制医院内传播为主的综合性预防措施。
在临床治疗上，由于呼吸生理和重症监护医学包括仪器设备的创新，以及重症监护病房（ICU）组织及管理系统的建立，特别是呼吸支持技术的发展与完善，极大地丰富了重症患者呼吸衰竭抢救的理论与实践，降低了病死率。对睡眠状态的全套临床生理学监测和无创正压通气为睡眠呼吸障碍的诊断和治疗提供了全面的技术手段。新一代的各种抗生素（如四代头孢菌素，新一代喹诺酮类，碳青霉烯类等）对产超广谱p内酰胺酶（ESBI，s）的阴性杆菌具有更强的治疗作用。新型嗯唑烷酮类（如利奈唑胺）及糖肽类（如替考拉宁）抗生素对耐甲氧西林葡萄球菌的疗效与万古霉素相似，副作用更少。新一代的抗真菌药物（如两性霉素B脂质体、伏立康唑、卡泊芬净等），对各类真菌感染疗效更佳，副作用更少。
微创技术（如胸腔镜）的使用可对一些肺功能差的患者施行肺部手术，各种通气模式的改进可对不同的病因引起的呼吸衰竭进行针对性的治疗。由于非创伤性面（鼻）罩通气的推广，将能预防一些患者（如慢性阻塞性肺疾病，神经肌肉疾病）发展为呼吸衰竭，并使部分患者避免气管插管或切开。而肺移植的开展，将成为失代偿呼吸功能不全的重要治疗手段。
