1.伴随症状
脓尿伴有肾绞痛，提示病变在肾脏见于肾结石，肾脓肿，多囊肾等。伴有全身感染中毒症状提示上尿路感染。病史中应注意腰痛，膀脱刺激症状：尿频、尿急、尿痛，尿液浑浊。儿童有时以发热鼓肠形式出现，易误诊为发热待查。新婚女性易有便意感，但粪便无论肉眼观察，还是镜下观察均为正常，而查尿方可发现异常，容易误诊。
2.体格检查
肾区压痛、叩击痛、上输尿管压痛点（腹直肌外缘平脐处）肋腰点压痛点腰大肌与十二肋骨交叉处）见于上尿路感染， 多囊肾合并感染时或上段输尿管梗阻大量肾盂积液时，上腹可触及肿大的变形的肾脏。
3.实验室检查
脓尿菌尿是其特点。尿液的常规检查除白细胞、脓细胞增加外，注意白细胞和脓细胞管型。小圆上皮细胞存在代表上尿跟染。血常规白细胞总数及中性粒细胞增加。
慢性肾盂肾炎：脓尿常常间断出现，注意反复验尿；有时须做尿液细胞计数称埃迪计数检查，每小时白细胞＞40万观万个或每1ml尿液＞2000个，或每分钟＞4000个均列为异常。有时须做激发试验，静注氢化考的松 100mg，或氟美松5mg，或泼尼松30mg，连用3d，再做尿液白细胞计数，较试验前增加一倍列为异常。尿液涂片找致病菌，可迅速做出诊断。慢性肾盂肾炎注意肾功能的检查，肾小管功能持续受损最常见。
X线静脉肾盂造影对诊断慢性肾盂肾炎和复杂性肾盂肾炎有帮助，但患者对碘过敏或已有肾功能损害时应列为禁忌。
