近日发现巴氏腺囊肿增大了，两侧都有鸡蛋大小了，

病情分析：
你这种情况考虑巴氏腺囊肿合并感染的可能性比较大，建议去当地医院妇科就诊，目前要注意个人卫生，保持局部清洁，注意饮食，避免辛辣刺激食物，可以用1:5000高锰酸钾溶液泡洗。巴氏腺囊肿手术并不大，手术对胎儿的影响也不大。只要症状严重，随时可以进行手术。

病情分析：
根据您描述的情况，近期囊肿有增大的情况，怀孕也进入孕晚期，是可以进行囊肿的引流手术。

指导意见：
建议您可以现在就进行引流手术，对胎儿的影响不会很大，建议您也可以等抛宫产手术之后，再行引流手术。