阴茎根部有不适感，肾部有轻微不适感

病情分析：
这种情况最好到医院做一个检查，看看是不是因为肾脏疾病所引起的，尿道炎，膀胱炎、肾炎、以及泌尿系统的结石都有可能造成尿的颜色变深。当然也有正常的情况，尿液颜色变深，比如喝水少，造成的浓缩尿。

病情分析：
如果想简单的调理，那么可以服用一些银花泌炎灵片或者前列舒乐胶囊等调理一下生殖保健功能

指导意见：
如果方便也可以去做一下尿液化验检查，避免确实存在的一些疾病问题，近期也要避免过多的手淫、性行为等一些不利的因素影响。