上呼吸道急性感染如不及时治疗，可引起很多并发症，特别在婴幼儿时期更为多见。
并发症可分三大类：
1.感染自鼻、咽部蔓延至附近器官，较为常见者为急性眼结膜炎、鼻窦炎、口腔炎、喉炎、中耳为及颈淋巴结炎，其它如咽后壁脓肿、扁桃体周围脓肿、上颌骨骨髓炎、支气管炎及肺炎等亦不少见。
2.病原通过血循环播散至全身，细菌感染并发败血症时，可导致化脓性病灶，如皮下脓肿、脓胸、心包炎、腹膜炎、关节炎、骨髓炎、脑膜炎、脑脓肿以及泌尿道感染等。
3.由于感染有变态反应对机体的影响，可发生风湿热、肾炎、心肌炎、肝炎、紫癜、类风湿病及其他结缔组织性疾病等。
