1.病因治疗 针对其致病原因，如肺气肿、慢性支气管炎、肠梗阻等进行相应的针对性治疗，是治愈的关键。
2.改善营养 据报道，加强营养并补充维生素B类药物，可使症状缓解甚至消失，有较好的疗效。
3.氧疗 给患者连续高浓度的氧气(70%～75%)吸入，可使血液内氧分压升高，而置换肠气囊肿内的气体，从而使囊肿消失。
4.中药治疗 应用大量三七(3～4.5g/d)及云南白药(0.6g，口服，每6小时1次)，可能使病变缓慢，这可能是由于大量三七和云南白药有活血化瘀之功效。有人用龟板、土茯苓、鹅不食草治疗也取得了一定的疗效。
5.药物灌肠 有报道，以浓茶及云南白药灌肠，或以浓茶加锡类散(1～2管，1次/d)保留灌肠，15天为一疗程，休息10天可再进行下一疗程，治疗半年可痊愈，也有单用浓茶水灌场，1000ml/d，持续3个月后治愈的报道，认为可能与茶叶中所含鞣酸的收敛作用有关。
6.纤维结肠镜下治疗 发现气囊肿后，先用活检钳将气囊肿夹破，然后将内镜微波治疗仪的同轴电缆通过内镜活检孔插入，电极头伸出活检孔3～4cm，并接触囊肿进行凝固。微波输出功率可用40w，每次2～3s，治疗后局部黏膜呈灰白色凝固。此法具有组织损伤小、简便、安全等优点。
7.外科治疗 对反复出血或不全梗阻的病例，有人主张可手术切除病变的肠段。但应注意，不要用电切，以免气囊肿内气体爆炸。