1.手术治疗
治疗主要靠手术，故应争取早期诊断，应争取在压迫症状或并发证发生前施行。许多患者直到出现明显症状如肝硬化、黄疸和门脉高压才就诊时往往已错过手术根治时机。
手术前应先用细针将囊液抽去，慎防囊液外溢，然后将内囊摘除。内囊与外囊仅有轻度粘连，极易剥离，常可完整取出。在手术摘除包虫内囊之前，向囊内注入2%甲醛(福马林)、0.01%过氧化氢、1%碘剂、0.05%次氯酸或25%甘油等可起到杀死原头蚴的作用，后4者的疗效较甲醛为佳，过氧化氢及甘油的毒性也较低微。
2.药物治疗
(1)甲苯达唑(甲苯咪唑) 口服，共16～48周治疗包虫病，患者均能耐受;但有人在应用药物3个月后，取囊液作动物接种，仍获阳性结果，故认为本品口服后血浓度低，疗效尚难定论，目前只作为手术疗法的辅助治疗。
(2)阿苯达唑(丙硫咪唑) 在组织中与包虫囊内的浓度高，口服，30天为一疗程，其疗效尚满意。