青霉菌病需和曲霉病相鉴别。在组织内，青霉菌表现为分支分隔的菌丝，与曲霉相似，若在组织内发现曲霉菌分生孢子头或青霉菌帚状支，则可明显区别。取活组织进行分离培养在鉴别诊断上有重要意义。