(一) 发生于鼻副窦的骨瘤 多见于额及筛窦，常呈分叶状，可有蒂，边缘整齐，密度均匀一致，长大可占满鼻窦腔，甚至顶起窦壁，引起额面畸形，一般诊断不困难。
(二) 发生于颅骨者 应与脑膜瘤，额骨内板增生症和纤维异样增殖症鉴别。
1. 脑膜瘤 生长快，呈不整形新骨增生，可出现骨样改变，瘤基底宽，并可有颅板溶骨改变，肿瘤血供增多，致附近血管沟影增宽增多，眼眶筛部骨瘤有时与嗅沟的脑膜瘤不易区分。
2. 额骨内板增生症 呈波浪性骨增生，患者常有头痛，肥胖，性欲减退，多见于停经后的女性，有时伴发糖尿病或尿崩。
3. 颅骨纤维异样增殖症 病变广泛，基底宽，多处发病，累及板障和颅板，全身其它骨骼亦可发病，且有单侧趋向。
(三) 发生于肢体者 应与骨软骨瘤，骨肉瘤区分。
1. 外生骨疣 如全身骨质则为骨瘤，有谓 实为骨软骨瘤，内含软骨成份钙化，二者不易区分，有赖于病检。
2. 内生肌疣(Enoslosis)亦称骨斑(Bone Spot)或骨岛(Bone Islaand)，为松质骨内骨发育异常，骨内呈巢状，可有骨小梁，不属肿瘤。
3. 骨肉瘤 生长迅速，具恶性骨肿瘤特点，有无好发年龄与部位，易区分。
