手术切除是FNHL的有效的首选治疗，一般认为FNHL不发生癌变，有人主张对明确诊断为FNH的无症状者，可以保守治疗，严密随访。但一般认为基于以下理由仍应积极采用手术治疗：①FNHL较少见，影像学难于定性，最后的诊断仍须病理学判断，在鉴别诊断上仍有一定的困难，误诊率较高。特别是在影像学上无法与肝脏恶性肿瘤相鉴别时，可避免延误治疗。②患者年龄较轻或肿瘤较大，在日常生活中可能引起破裂出血者。③患者有明显症状且精神负担较重者。④手术疗效肯定，术后长期随诊无复发。
对于有手术禁忌或肿块巨大不适宜手术治疗的病人，可采用肝动脉栓塞，使肿块缩小，但仍须严密观察，定期随诊。