西医病因：
任何致病菌都可引起肾盂肾炎，但绝大部分为革兰阴性杆菌，如大肠杆菌、副大肠杆菌、变形杆菌、产碱杆菌、产气杆菌、硝酸盐杆菌、厌氧杆菌及绿脓杆菌，其中以大肠杆菌最为多见，约占60%～70%。球菌引起主要为葡萄球菌及粪链球菌，但较少见。正常人尿道内常有小量细菌存在，但多数为非致病菌。男性前尿道3～5cm处舟状窝处常有菌，女性尿道外段1cm处亦有细菌，中段80%有菌，近膀胱4cm处约50%有细菌，每当机体抵抗力下降时，致病细菌乘虚而入。此外还有下列因素：①尿路梗阻，如尿路结石、肿瘤、狭窄、前列腺肥大等致使尿流不畅，细菌逆流到肾、肾盂肾小管返流感染引起肾内感染并形成疤痕。梗阻上方肾组织压力增高，压迫动脉使肾内血流量减少，肾组织抵抗力下降则更有利于感染发生和细菌繁殖。②尿路器械使用。③性生活和妊娠。④尿路畸形或功能缺陷。上述诱因均可导致急性肾盂肾炎的发生。
中医病因：
其病因根据中医文献中的有关论述：如唐·孙思邈所著《千金要方》在淋病的病因学说方面又作以下补充，提出饮酒过度和过服温补之剂亦可成淋之说，并进一步明确了淋病的病位是热结下焦。宋·陈言对淋病的病因分类，遵循了三因分类的原则，充分体现了他的“三因致病”学说。金·李东垣认为肝气横郁，郁必生火，从而也导致淋病的产生等。
发病机理：
细菌侵入泌尿系统要通过上行(逆行感染)、血行(血行感染)、淋巴路及直接蔓延四条途径，其中上行感染最为常见，血行感染次之。①上行感染：细菌由尿道外口、膀胱、输尿管逆行直达肾脏。其致病菌以大肠杆菌最为常见。健康人尿道附近及尿道内存在细菌，可经器械或导尿管带入而引起上行感染。留置导尿的患者，在 10天之后几乎全部引起膀胱炎和肾盂肾炎。上行以女性多见，与解剖生理特点有关。②血行感染：细菌由感染灶(如心内膜炎或肺炎或皮肤疖痈等) 自血流进入肾脏引起急性肾盂肾炎。致病菌以球菌为多见。③淋巴道感染：肾脏、输尿管、膀胱的淋巴管是相通的，特别是升结肠与右肾的淋巴管是沟通的，故当盆腔器官炎症(如结肠炎、膀胱炎或阑尾炎)，细菌可从淋巴道感染肾脏。④直接感染：肾脏或尿路邻近器官或组织的感染，细菌可直接侵入肾脏引起急性肾盂肾炎。
中医病机：
急性肾盂肾炎的中医病机可概括为以下几点。 1.膀胱湿热 多食甘肥辛热之口，或嗜酒太过，酿成湿热，下注膀胱，或下阴不洁，秽浊之邪侵入膀胱，而成湿热，发为淋病。如尿热涩痛则属热淋;若热盛损伤血络，迫血妄行，小便涩痛有血为血淋。 2.肝郁气滞 恼怒伤肝，气滞不畅，气郁化火，或气火郁于下焦，影响膀胱的气化，则少腹作胀，小便艰涩而痛，余沥不尽而发力气淋。 3.脾肾气虚 老年有中气不足，气虚下陷者，亦力气淋;肾气亏虚下元不固，不能制约脂液，脂液下泄，尿液浑浊，则为膏淋。 4.肾阴亏虚 肾阴亏虚，虚火灼络，尿中挟血，尿热涩痛，可为血淋，可为热淋。
病理：
病理检查①肉眼所见病变单侧或双侧肾脏，肾盂粘膜充血水肿，表面有脓性分泌物，粘膜下可有细小的脓疡，于一个或数个肾乳头可见大小不一，尖端指向肾乳头的，底部伸展向皮质的楔形炎症病灶。②显微镜检查，病灶内可见肾小管中有脓性分泌物，小管上皮细胞肿胀、坏死、脱落，间质内有白细胞浸润和小脓肿形成，炎症剧烈时，可有广泛性出血。肾小球一般无形态改变，但周围可有轻度白细胞浸润。上述炎症病灶可完全愈合，大的病灶可留疤痕。
