1.尿道结核（1）尿道分泌物、尿频、尿痛、尿道流血或血尿；（2）排尿困难、尿线变细、尿射程缩短、排尿无力；（3）会阴部扪到粗、硬呈索条状的尿道或形成尿道娄；（4）尿道造影示尿道狭窄；（5）尿道分泌物直接涂片找到结核菌有助诊断；（6）经尿道行活组织检查可确诊。

2.阴茎结核（1）阴茎头上硬结及慢性溃疡；（2）直接涂片或结核菌培养找到结核菌可区别软性下疳、硬性下疳、阴茎阿米巴病和阴茎癌；（3）病理活检可确诊。