1.嵌杯样病毒胃肠炎潜伏期1～3天，以吐泻为主要症状。儿童患者以呕吐为主要表现，约半数患儿可伴有上呼吸道症状，少数可有发热及皮疹。成人则以腹泻、水样便为主要表现，可伴有恶心、呕吐、腹痛、头痛及周身不适等。病程3～5天。
2.患儿病情差别较大，6～24月龄小儿症状重，而较大儿童多为轻型或亚临床感染。本病为自限性疾病，病程约1周。但少数患儿短期内仍有双糖尤其是乳糖吸收不良，腹泻可持续数周，个别可长达数月。
3.成人嵌杯样病毒胃肠炎潜伏期2～3天，起病急，多无发热或仅有低热，以腹泻、腹痛、腹胀为主要症状。腹泻每日3～10次不等，为黄水样或米汤样便，无脓血。部分病例伴恶心、呕吐等症状。病程3～6天，偶可长达10天以上。少数患者可并发肠套叠、直肠出血、溶血尿毒综合征、脑炎及Reye综合征等。