十二指肠结核缺乏特有的临床表现，本病多见于青壮年，好发于20～40岁，尤以女性患者居多。主要经口感染，起病隐匿，进展缓慢，病程较长，早期症状不明显。临床表现如下：
1.十二指肠梗阻症状 为十二指肠结核最常见，主要表现腹痛和呕吐。多在进食后出现上腹部饱胀感或疼痛不适，恶心、呕吐，呕吐后上腹部疼痛或饱胀感减轻。Gupta等报告30例十二指肠结核患者，其中22例表现为胃十二指肠梗阻;曹涛等报告16例，表现为胃十二指肠梗阻的有13例。
2.消化不良症状 表现为上腹不适、腹胀、恶心，服抗酸药治疗无效。
3.结核中毒症状 部分患者可有低热、盗汗、乏力、厌食和消瘦。
4.其他症状 少数患者可以上消化道出血为首发表现，还有些患者可出现与相邻组织或器官如肾盂、胆管之间的内瘘。
5.十二指肠结核的体征 主要有上腹部压痛、右上腹肿块、振水音阳性、浅表淋巴结肿大。