随着病情进展，食管结核可并发牵引性憩室乃至憩室穿孔、食管梗阻、喉返神经麻痹、食管纵隔瘘、食管胸膜瘘以及食管气管瘘等并发症，并出现相应的症状和体征。最后，病人可长期发热、消耗、中毒及全身营养障碍而出现恶液质，再合并各种条件致病菌感染，导致病人死亡。