本病有自限性，约1-2周即可自愈。治疗的目的是防止下次复发。本病目前尚无特效药物，治疗原则为缩短病程，防止继发感染，减少复发。
1.局部疗法：原则为干燥、收敛、保护患部，防止继发感染。可外涂2%龙胆紫溶液，或选用10%次没食子酸铋(代马妥dermatol)、氧化锌油膏或泥膏、紫草生地榆油膏、0.5%新霉素软膏、或0.25%~0.1%疱疹净(IDU)软膏、5%疱疹净二甲基亚砜溶液(用于皮肤疱疹)等。对颜面部者亦可用10%醋酸铝或锌铜合剂。
2.全身治疗：治疗原则其一使感染的HSV不能活化，甚至消灭病毒;其二调节免疫，防止再发，可用阿昔洛韦静滴或口服，丽珠威口服，干扰素肌注，白细胞介素Ⅱ肌注。我们在治疗复发性生殖器疱疹时，使用四医大生物技术中心产的干扰素300万单位肌注，每日一次，10次为一疗程，共三个疗程，适当配合使用白细胞介素Ⅱ或利百多或灵杆菌素，95%的病人不复发。
2.病原疗法
(1)阿昔洛韦(无环鸟苷)：可选择性地抑制病毒复制，减少新损害的发生，减轻疼痛，缩短创面愈合及排毒时间。对原发性或初次发作的GH，0.2g，口服，5次/d，连用7～10天;对复发性GH，0.2g，口服，5次/d，连用5天，或0.4g，口服，3次/d，连用5天，或0.8g，口服，2次 /d，连用5天。轻症患者1～1.6g/d，分5次口服，连用5～7天;重症病人15mg/(kg・d)，静注，连用5～7天。脱水和肾功能不全者慎用。近年来， 伐昔洛韦(万乃洛韦)、泛昔洛韦(famciclorvir)等阿昔洛韦(ACV)的衍生物也用于本病的治疗。
(2)膦甲酸钠：对有TK基因缺陷的耐ACV病毒感染者，可用膦甲酸钠40mg/kg，静注，每8小时1次，至痊愈。
(3)利巴韦林(三氮唑核苷)：0.6～0.8g/d，口服或肌注，连用5～7天。
(4)α、β及γ-干扰素(α、β、γ-IFN)：100万u/d，共5～7天。
(5)聚肌胞 2～4ml，肌注，隔天1次，连用5～7天。
(6)阿糖胞苷(cytarabine)等也可用。
3.免疫疗法 Straus等采用gD-2疫苗接种，即重组HSV-2在CHO细胞表达的糖蛋白D，诱导的抗原特异性中和抗体相当于或超过GH患者产生的水平。100µg/次，2个月后重复1次，与对照组相比，复发次数明显减少，对减轻症状和预防感染也有效。
4.局部疗法 应注意保护创面，保持清洁、干燥，防止继发细菌感染。5%阿昔洛韦(ACV)软膏或乳剂、α或β干扰素乳剂或凝胶、1%甲紫(龙胆紫)溶液、3%四环素软膏或25%氧化锌油剂等均可使用。
5.对症疗法 如继发细菌感染，应酌用抗生素。若疼痛剧烈时可予以止痛剂。
6.性伴侣的处理 由于大多数性伴侣可能已经感染HSV，因此他们也应接受检查，必要时予以治疗。
